El Area de Conservación Privada Huiquilla tiene una topografía muy variada. Su rango altitudinal de aproximadamente 1,000 metros entre la parte baja y la jalca y la presencia de llanos, quebradas, lomas y grandes pendientes determinan la existencia de diferentes microclimas que permiten el desarrollo de una gran biodiversidad de fauna y flora.

Desde la primera evaluación biológica realizada en julio del 2006 a la fecha se han registrado 207 especies de plantas vasculares, destacando la familia Asteraceae con 38 especies, seguida por las Orchidaceae con 27 especies y un nuevo registro para la ciencia denominada Epidendrum latorreorum.

Con respecto a las listas de categorización, en el ACP Huiquilla hay dos grandes grupos de plantas vasculares que resaltan, estos son: las orquídeas y los helechos arbóreos pertenecientes al género Cyathea. Ambos grupos se encuentran en apéndice II del CITES (Convention on Internacional Trade in Endangered Species of Wild Fauna and Flora) y algunas especies en la categorización de especies nacional como casi amenazado y vulnerable debido a la destrucción de hábitats y la extracción selectiva de especies.